内容简介
本书系统地介绍使用 treeio、tidytree、ggtree 和 ggtreeExtra 等 R 软件包操作系统发育树的全套流程，包括对树文件的解析，以及树与其相关数据的操作、整合、可视化等内容。本书由余光创撰写，旨在为系统发育树的操作与呈现提供指导。如果读者需要进行系统发育树的相关操作，却又觉得无从下手，那么这本书会提供很大的帮助。关于系统发育树的大部分问题，都能在本书中找到答案。 本书适合从事生命科学研究的科学家、研究生和生物信息工程师学习使用；也适合作为系统发育相关课程的本科生、研究生和科研工作者的教材使用。
AI简介
这是一本系统介绍如何使用R软件包操作系统发育树的全套流程的书籍，包括对树文件的解析，以及树与其相关数据的操作、整合、可视化等内容。本书由余光创撰写，旨在为系统发育树的操作与呈现提供指导。如果读者需要进行系统发育树的相关操作，却又觉得无从下手，那么这本书会提供很大的帮助。关于系统发育树的大部分问题，都能在本书中找到答案。
本书首先介绍了系统发育树构建的流程，包括对树文件的解析，以及树与其相关数据的操作、整合、可视化等内容。这一流程通常使用R软件包进行操作。系统发育树是一种用于展示生物演化关系的图形表示方式，它通过将生物按照演化关系进行排列，形成一棵树状结构。在构建系统发育树的过程中，首先需要获取生物的基因序列数据，然后使用特定的算法对这些数据进行计算和分析，以确定生物之间的演化关系。
本书接着介绍了系统发育树操作的指导，主要涉及如何导入、处理、整合以及可视化系统发育树及其关联数据。系统发育树是生物学家用来描述生物群体之间谱系关系的工具，它基于生物的遗传序列构建，通常是有根树。本书中详细介绍了如何操作含有关联数据的树，以及如何选定和缩小进化枝等实用技巧。
此外，本书还详细介绍了余光创
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